Multiple STP (MSTP) جدیدترین پیاده‌سازی از STP است که از استفاده از VLANها پشتیبانی می‌کند. MSTP تعداد مورد نیاز از نمونه‌های spanning tree را تنظیم می‌کند، بدون توجه به تعداد VLANها در سوئیچ. هر نمونه می‌تواند شامل چندین گروه VLAN باشد. یکی از معایب MSTP این است که تمام سوئیچ‌هایی که از طریق MSTP ارتباط دارند باید تنظیمات گروه‌های VLAN یکسانی داشته باشند.
توجه: حداکثر 64 نمونه MSTP قابل تنظیم است.
مثال تنظیمات MSTP:
توجه: به طور پیش‌فرض، تمامی VLANها در نمونه 0 قرار دارند.